PROTEOMICKÁ ANALÝZA POTENCIÁLNÍCH MARKERŮ DILATAČNÍ KARDIOMYOPATIE PRO PREDIKCI VÝVOJE ONEMOCNĚNÍ

Cíl práce: identifikovat proteinové markery, které by mohly predikovat vývoj pozitivní remodelace levé komory srdeční (LVRR+) u pacientů s nově vzniklou dilatační kardiomyopatií (RODCM). Soubor a metodika: Ze souboru 100 pacientů s RODCM (pacienti z pracovišť 1.intení kardioangiologické kliniky FN Hradec Králové, IKEM Praha a 1.interní - kardiologické kliniky FN Olomouc) byly vybrány k proteomické analýze pacienti 1. a 4.kvartilu podle vývoje ejekční frakce levé komory za 12měsíců od zařazení do studie (49 pac., 51,3±14,7 let, 35 mužů). Výsledky: Na základě výsledku kvantitativní proteomické analýzy jsme metodami hmotn. spektrometrie, label-free kvantifikace a s využitím pokročilých anotačních nástrojů identifikovali 97 proteinů, které byly významně deregulovány mezi kontrolní zdravou a RODCM skupinou. Prkázali jsme, že dochází k významné deregulaci některých procesů souvisejících s komplementovou kaskádou, srážením krve a metabolismem lipidů. Následně jsme provedeli porovnání nemocných na základě dosažení/nedosažení LVRR (LVRR+, LVRR-). Zde jsme našli 45 proteinů, kterými se obě skpiny významně lišily (např. fruktóza-1,6-bisfosfát aldoláza, zvýšené hladiny imunoglobulinů a proteiny zapojených do procesů spojených s protilátkovou odpovědí a buněčnou adhezí). Získaná data jsme podrobili prediktivnímu modelování s použitím logistické regrese s optimalizací typu elastic net. Takto získaný model trénovaný na části naměřených dat poskytoval v testování průměrnou přesnost zařazení do jednotlivých skupin až 96 % u srovnání DCM oproti zdravým kontrolám a 88 % u srovnání pacientů s LVRR+ a LVRR-. Závěr: Výsledky naší studie prokázaly exstenci některých proteinů, které by bylo možné po jejich ověření využít v predikci vývoje reverzní remodelace levé komory. Tato práce byla podpořena grantem č. NV19-02-00297 Ministerstva zdravotnictví České republiky.